Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SgcdP82347 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SgcdP82347 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SgcdP82347 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SgcdP82347 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SgcdP82347 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SgcdP82347 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SgcdP82347 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SgcdP82347 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SgcdP82347 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SgcdP82347 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SgcdP82347 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SgcdP82347 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SgcdP82347 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SgcdP82347 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SgcdP82347 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SgcdP82347 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SgcdP82347 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SgcdP82347 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SgcdP82347 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SgcdP82347 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SgcdP82347 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SgcdP82347 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SgcdP82347 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SgcdP82347 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SgcdP82347 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SgcdP82347 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SgcdP82347 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SgcdP82347 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SgcdP82347 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SgcdP82347 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SgcdP82347 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SgcdP82347 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SgcdP82347 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SgcdP82347 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SgcdP82347 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SgcdP82347 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SgcdP82347 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SgcdP82347 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SgcdP82347 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SgcdP82347 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SgcdP82347 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SgcdP82347 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SgcdP82347 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SgcdP82347 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SgcdP82347 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SgcdP82347 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SgcdP82347 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SgcdP82347 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SgcdP82347 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SgcdP82347 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SgcdP82347 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SgcdP82347 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SgcdP82347 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SgcdP82347 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SgcdP82347 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SgcdP82347 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SgcdP82347 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SgcdP82347 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SgcdP82347 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SgcdP82347 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SgcdP82347 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SgcdP82347 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SgcdP82347 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SgcdP82347 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SgcdP82347 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SgcdP82347 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms