Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufd1P70362 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufd1P70362 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufd1P70362 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufd1P70362 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufd1P70362 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufd1P70362 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufd1P70362 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufd1P70362 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufd1P70362 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufd1P70362 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufd1P70362 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufd1P70362 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ufd1P70362 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ufd1P70362 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufd1P70362 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufd1P70362 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufd1P70362 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufd1P70362 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufd1P70362 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufd1P70362 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufd1P70362 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufd1P70362 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufd1P70362 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufd1P70362 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ufd1P70362 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufd1P70362 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufd1P70362 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufd1P70362 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufd1P70362 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufd1P70362 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufd1P70362 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufd1P70362 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufd1P70362 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufd1P70362 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufd1P70362 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufd1P70362 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufd1P70362 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufd1P70362 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufd1P70362 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufd1P70362 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufd1P70362 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ufd1P70362 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ufd1P70362 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufd1P70362 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufd1P70362 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufd1P70362 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ufd1P70362 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ufd1P70362 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ufd1P70362 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ufd1P70362 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ufd1P70362 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ufd1P70362 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ufd1P70362 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufd1P70362 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ufd1P70362 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms