Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Msx3P70354 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Msx3P70354 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Msx3P70354 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Msx3P70354 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msx3P70354 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Msx3P70354 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Msx3P70354 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Msx3P70354 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Msx3P70354 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Msx3P70354 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Msx3P70354 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Msx3P70354 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Msx3P70354 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Msx3P70354 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Msx3P70354 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Msx3P70354 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msx3P70354 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Msx3P70354 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Msx3P70354 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msx3P70354 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Msx3P70354 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Msx3P70354 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Msx3P70354 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Msx3P70354 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Msx3P70354 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msx3P70354 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Msx3P70354 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msx3P70354 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Msx3P70354 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Msx3P70354 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Msx3P70354 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Msx3P70354 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Msx3P70354 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Msx3P70354 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Msx3P70354 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Msx3P70354 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Msx3P70354 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Msx3P70354 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Msx3P70354 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Msx3P70354 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Msx3P70354 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Msx3P70354 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Msx3P70354 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Msx3P70354 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Msx3P70354 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Msx3P70354 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Msx3P70354 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Msx3P70354 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Msx3P70354 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Msx3P70354 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Msx3P70354 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msx3P70354 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msx3P70354 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Msx3P70354 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Msx3P70354 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Msx3P70354 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Msx3P70354 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Msx3P70354 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msx3P70354 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Msx3P70354 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Msx3P70354 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Msx3P70354 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msx3P70354 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msx3P70354 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Msx3P70354 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Msx3P70354 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msx3P70354 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msx3P70354 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Msx3P70354 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Msx3P70354 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Msx3P70354 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Msx3P70354 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Msx3P70354 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Msx3P70354 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Msx3P70354 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Msx3P70354 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Msx3P70354 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Msx3P70354 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Msx3P70354 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Msx3P70354 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Msx3P70354 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Msx3P70354 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Msx3P70354 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Msx3P70354 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Msx3P70354 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Msx3P70354 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Msx3P70354 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msx3P70354 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msx3P70354 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msx3P70354 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Msx3P70354 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Msx3P70354 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms