Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smad1P70340 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smad1P70340 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Smad1P70340 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smad1P70340 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smad1P70340 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smad1P70340 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smad1P70340 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smad1P70340 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smad1P70340 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smad1P70340 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smad1P70340 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smad1P70340 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smad1P70340 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smad1P70340 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smad1P70340 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smad1P70340 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smad1P70340 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smad1P70340 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smad1P70340 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smad1P70340 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smad1P70340 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smad1P70340 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smad1P70340 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smad1P70340 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smad1P70340 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smad1P70340 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smad1P70340 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smad1P70340 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smad1P70340 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smad1P70340 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smad1P70340 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smad1P70340 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smad1P70340 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smad1P70340 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smad1P70340 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smad1P70340 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smad1P70340 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smad1P70340 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smad1P70340 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smad1P70340 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smad1P70340 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smad1P70340 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smad1P70340 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Smad1P70340 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Smad1P70340 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smad1P70340 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smad1P70340 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smad1P70340 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smad1P70340 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smad1P70340 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Smad1P70340 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smad1P70340 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smad1P70340 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smad1P70340 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smad1P70340 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smad1P70340 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smad1P70340 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smad1P70340 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smad1P70340 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smad1P70340 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smad1P70340 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smad1P70340 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smad1P70340 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smad1P70340 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smad1P70340 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smad1P70340 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smad1P70340 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smad1P70340 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smad1P70340 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smad1P70340 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smad1P70340 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smad1P70340 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smad1P70340 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smad1P70340 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smad1P70340 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smad1P70340 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smad1P70340 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smad1P70340 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smad1P70340 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smad1P70340 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smad1P70340 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smad1P70340 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smad1P70340 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smad1P70340 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smad1P70340 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Smad1P70340 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smad1P70340 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms