Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Stra8P70278 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Stra8P70278 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Stra8P70278 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Stra8P70278 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Stra8P70278 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Stra8P70278 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Stra8P70278 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Stra8P70278 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Stra8P70278 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Stra8P70278 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Stra8P70278 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Stra8P70278 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Stra8P70278 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Stra8P70278 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Stra8P70278 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Stra8P70278 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Stra8P70278 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Stra8P70278 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Stra8P70278 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Stra8P70278 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Stra8P70278 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Stra8P70278 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Stra8P70278 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Stra8P70278 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Stra8P70278 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Stra8P70278 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Stra8P70278 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Stra8P70278 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Stra8P70278 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Stra8P70278 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Stra8P70278 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Stra8P70278 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Stra8P70278 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Stra8P70278 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Stra8P70278 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Stra8P70278 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Stra8P70278 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Stra8P70278 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Stra8P70278 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Stra8P70278 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Stra8P70278 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Stra8P70278 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Stra8P70278 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Stra8P70278 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Stra8P70278 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Stra8P70278 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Stra8P70278 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Stra8P70278 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Stra8P70278 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Stra8P70278 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Stra8P70278 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Stra8P70278 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Stra8P70278 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Stra8P70278 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Stra8P70278 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Stra8P70278 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Stra8P70278 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Stra8P70278 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Stra8P70278 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Stra8P70278 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Stra8P70278 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Stra8P70278 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Stra8P70278 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Stra8P70278 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Stra8P70278 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Stra8P70278 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Stra8P70278 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Stra8P70278 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Stra8P70278 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Stra8P70278 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Stra8P70278 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stra8P70278 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Stra8P70278 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Stra8P70278 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Stra8P70278 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Stra8P70278 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Stra8P70278 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Stra8P70278 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Stra8P70278 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Stra8P70278 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Stra8P70278 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Stra8P70278 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Stra8P70278 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Stra8P70278 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Stra8P70278 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Stra8P70278 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Stra8P70278 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Stra8P70278 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Stra8P70278 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Stra8P70278 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Stra8P70278 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Stra8P70278 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms