Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smg6P61406 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smg6P61406 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smg6P61406 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smg6P61406 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smg6P61406 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Smg6P61406 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Smg6P61406 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Smg6P61406 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Smg6P61406 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Smg6P61406 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Smg6P61406 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Smg6P61406 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Smg6P61406 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Smg6P61406 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Smg6P61406 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Smg6P61406 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Smg6P61406 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Smg6P61406 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Smg6P61406 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Smg6P61406 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Smg6P61406 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Smg6P61406 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smg6P61406 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Smg6P61406 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Smg6P61406 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Smg6P61406 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smg6P61406 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Smg6P61406 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smg6P61406 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smg6P61406 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smg6P61406 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smg6P61406 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Smg6P61406 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Smg6P61406 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Smg6P61406 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Smg6P61406 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Smg6P61406 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Smg6P61406 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smg6P61406 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Smg6P61406 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Smg6P61406 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Smg6P61406 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Smg6P61406 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Smg6P61406 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Smg6P61406 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Smg6P61406 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Smg6P61406 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Smg6P61406 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Smg6P61406 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Smg6P61406 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Smg6P61406 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Smg6P61406 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Smg6P61406 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Smg6P61406 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smg6P61406 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smg6P61406 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Smg6P61406 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smg6P61406 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smg6P61406 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smg6P61406 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smg6P61406 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smg6P61406 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smg6P61406 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Smg6P61406 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smg6P61406 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smg6P61406 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Smg6P61406 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Smg6P61406 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Smg6P61406 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smg6P61406 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Smg6P61406 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smg6P61406 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Smg6P61406 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smg6P61406 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Smg6P61406 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Smg6P61406 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Smg6P61406 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Smg6P61406 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smg6P61406 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smg6P61406 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smg6P61406 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smg6P61406 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smg6P61406 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Smg6P61406 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smg6P61406 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smg6P61406 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smg6P61406 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smg6P61406 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smg6P61406 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smg6P61406 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Smg6P61406 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smg6P61406 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smg6P61406 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smg6P61406 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smg6P61406 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Smg6P61406 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Smg6P61406 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Smg6P61406 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Smg6P61406 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.5 ms