Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2d1P61080 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2d1P61080 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2d1P61080 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2d1P61080 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2d1P61080 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2d1P61080 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2d1P61080 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2d1P61080 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2d1P61080 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2d1P61080 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2d1P61080 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2d1P61080 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2d1P61080 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2d1P61080 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2d1P61080 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2d1P61080 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2d1P61080 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2d1P61080 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2d1P61080 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2d1P61080 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2d1P61080 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2d1P61080 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2d1P61080 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2d1P61080 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2d1P61080 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2d1P61080 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2d1P61080 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2d1P61080 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2d1P61080 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2d1P61080 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2d1P61080 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2d1P61080 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2d1P61080 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2d1P61080 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2d1P61080 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2d1P61080 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2d1P61080 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2d1P61080 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2d1P61080 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2d1P61080 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d1P61080 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d1P61080 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d1P61080 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d1P61080 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d1P61080 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms