Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne2P59108 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne2P59108 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne2P59108 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne2P59108 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne2P59108 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne2P59108 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne2P59108 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne2P59108 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne2P59108 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne2P59108 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpne2P59108 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne2P59108 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne2P59108 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne2P59108 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne2P59108 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne2P59108 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne2P59108 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne2P59108 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne2P59108 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne2P59108 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne2P59108 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne2P59108 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne2P59108 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne2P59108 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne2P59108 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne2P59108 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne2P59108 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne2P59108 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne2P59108 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne2P59108 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpne2P59108 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne2P59108 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne2P59108 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne2P59108 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne2P59108 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne2P59108 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne2P59108 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne2P59108 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpne2P59108 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne2P59108 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne2P59108 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms