Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh11P55288 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh11P55288 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh11P55288 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh11P55288 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh11P55288 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh11P55288 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh11P55288 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh11P55288 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh11P55288 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh11P55288 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh11P55288 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh11P55288 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh11P55288 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh11P55288 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh11P55288 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh11P55288 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdh11P55288 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh11P55288 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh11P55288 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh11P55288 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh11P55288 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh11P55288 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh11P55288 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdh11P55288 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh11P55288 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh11P55288 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh11P55288 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh11P55288 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh11P55288 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh11P55288 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh11P55288 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh11P55288 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh11P55288 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh11P55288 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh11P55288 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh11P55288 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh11P55288 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh11P55288 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh11P55288 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh11P55288 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdh11P55288 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh11P55288 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh11P55288 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh11P55288 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh11P55288 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh11P55288 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh11P55288 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh11P55288 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh11P55288 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh11P55288 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdh11P55288 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdh11P55288 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdh11P55288 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdh11P55288 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh11P55288 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdh11P55288 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdh11P55288 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdh11P55288 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdh11P55288 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdh11P55288 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdh11P55288 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdh11P55288 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh11P55288 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdh11P55288 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdh11P55288 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdh11P55288 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdh11P55288 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh11P55288 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdh11P55288 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh11P55288 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdh11P55288 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms