Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcl5P50228 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcl5P50228 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcl5P50228 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcl5P50228 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl5P50228 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcl5P50228 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcl5P50228 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcl5P50228 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl5P50228 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcl5P50228 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl5P50228 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl5P50228 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcl5P50228 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl5P50228 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcl5P50228 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl5P50228 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl5P50228 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl5P50228 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl5P50228 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl5P50228 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl5P50228 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl5P50228 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl5P50228 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl5P50228 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl5P50228 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cxcl5P50228 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl5P50228 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl5P50228 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl5P50228 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl5P50228 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl5P50228 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl5P50228 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxcl5P50228 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxcl5P50228 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl5P50228 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cxcl5P50228 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxcl5P50228 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cxcl5P50228 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cxcl5P50228 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl5P50228 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cxcl5P50228 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cxcl5P50228 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cxcl5P50228 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cxcl5P50228 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl5P50228 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cxcl5P50228 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cxcl5P50228 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl5P50228 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl5P50228 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl5P50228 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl5P50228 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl5P50228 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl5P50228 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl5P50228 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl5P50228 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl5P50228 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl5P50228 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl5P50228 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl5P50228 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl5P50228 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl5P50228 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl5P50228 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl5P50228 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl5P50228 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl5P50228 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl5P50228 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl5P50228 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl5P50228 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl5P50228 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl5P50228 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl5P50228 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms