Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psen1P49769 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psen1P49769 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psen1P49769 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psen1P49769 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psen1P49769 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Psen1P49769 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psen1P49769 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psen1P49769 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psen1P49769 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psen1P49769 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psen1P49769 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psen1P49769 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psen1P49769 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psen1P49769 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psen1P49769 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psen1P49769 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psen1P49769 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psen1P49769 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psen1P49769 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psen1P49769 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psen1P49769 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psen1P49769 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psen1P49769 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psen1P49769 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Psen1P49769 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psen1P49769 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psen1P49769 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psen1P49769 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psen1P49769 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Psen1P49769 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psen1P49769 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psen1P49769 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psen1P49769 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psen1P49769 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psen1P49769 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psen1P49769 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psen1P49769 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psen1P49769 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psen1P49769 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psen1P49769 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psen1P49769 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psen1P49769 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psen1P49769 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psen1P49769 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psen1P49769 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psen1P49769 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psen1P49769 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psen1P49769 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psen1P49769 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psen1P49769 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psen1P49769 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psen1P49769 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psen1P49769 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psen1P49769 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psen1P49769 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psen1P49769 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Psen1P49769 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen1P49769 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psen1P49769 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psen1P49769 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psen1P49769 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen1P49769 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psen1P49769 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psen1P49769 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psen1P49769 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Psen1P49769 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psen1P49769 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psen1P49769 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psen1P49769 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psen1P49769 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Psen1P49769 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen1P49769 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psen1P49769 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen1P49769 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psen1P49769 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psen1P49769 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psen1P49769 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psen1P49769 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Psen1P49769 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psen1P49769 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psen1P49769 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psen1P49769 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Psen1P49769 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Psen1P49769 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Psen1P49769 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psen1P49769 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Psen1P49769 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms