Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prox1P48437 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prox1P48437 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prox1P48437 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prox1P48437 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prox1P48437 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prox1P48437 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prox1P48437 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prox1P48437 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prox1P48437 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prox1P48437 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prox1P48437 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prox1P48437 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prox1P48437 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prox1P48437 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prox1P48437 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prox1P48437 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prox1P48437 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prox1P48437 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prox1P48437 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prox1P48437 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prox1P48437 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prox1P48437 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prox1P48437 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prox1P48437 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prox1P48437 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prox1P48437 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prox1P48437 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prox1P48437 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prox1P48437 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Prox1P48437 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prox1P48437 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prox1P48437 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prox1P48437 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prox1P48437 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prox1P48437 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prox1P48437 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prox1P48437 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prox1P48437 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prox1P48437 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prox1P48437 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prox1P48437 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prox1P48437 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prox1P48437 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prox1P48437 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prox1P48437 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prox1P48437 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prox1P48437 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prox1P48437 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prox1P48437 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prox1P48437 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prox1P48437 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prox1P48437 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prox1P48437 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prox1P48437 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prox1P48437 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prox1P48437 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prox1P48437 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prox1P48437 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prox1P48437 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prox1P48437 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prox1P48437 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prox1P48437 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prox1P48437 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prox1P48437 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox1P48437 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox1P48437 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prox1P48437 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prox1P48437 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms