Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp9P41245 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp9P41245 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp9P41245 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp9P41245 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp9P41245 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp9P41245 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp9P41245 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp9P41245 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp9P41245 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp9P41245 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp9P41245 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp9P41245 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp9P41245 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp9P41245 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp9P41245 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mmp9P41245 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mmp9P41245 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp9P41245 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp9P41245 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp9P41245 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp9P41245 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp9P41245 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp9P41245 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp9P41245 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp9P41245 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp9P41245 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp9P41245 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp9P41245 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp9P41245 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp9P41245 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp9P41245 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp9P41245 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp9P41245 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp9P41245 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp9P41245 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp9P41245 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp9P41245 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp9P41245 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp9P41245 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp9P41245 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp9P41245 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp9P41245 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp9P41245 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mmp9P41245 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp9P41245 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp9P41245 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp9P41245 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp9P41245 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp9P41245 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp9P41245 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp9P41245 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp9P41245 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp9P41245 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp9P41245 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp9P41245 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp9P41245 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp9P41245 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp9P41245 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp9P41245 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp9P41245 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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