Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Thbs1P35441 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Thbs1P35441 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thbs1P35441 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Thbs1P35441 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thbs1P35441 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thbs1P35441 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thbs1P35441 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thbs1P35441 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thbs1P35441 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thbs1P35441 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Thbs1P35441 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thbs1P35441 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thbs1P35441 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thbs1P35441 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thbs1P35441 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Thbs1P35441 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Thbs1P35441 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thbs1P35441 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Thbs1P35441 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Thbs1P35441 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Thbs1P35441 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Thbs1P35441 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Thbs1P35441 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Thbs1P35441 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Thbs1P35441 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thbs1P35441 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Thbs1P35441 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Thbs1P35441 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thbs1P35441 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Thbs1P35441 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thbs1P35441 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Thbs1P35441 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Thbs1P35441 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Thbs1P35441 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thbs1P35441 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thbs1P35441 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thbs1P35441 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Thbs1P35441 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thbs1P35441 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thbs1P35441 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thbs1P35441 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thbs1P35441 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thbs1P35441 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thbs1P35441 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thbs1P35441 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thbs1P35441 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thbs1P35441 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thbs1P35441 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Thbs1P35441 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Thbs1P35441 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Thbs1P35441 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thbs1P35441 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Thbs1P35441 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Thbs1P35441 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Thbs1P35441 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Thbs1P35441 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Thbs1P35441 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Thbs1P35441 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Thbs1P35441 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Thbs1P35441 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thbs1P35441 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thbs1P35441 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thbs1P35441 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thbs1P35441 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thbs1P35441 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Thbs1P35441 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Thbs1P35441 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Thbs1P35441 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Thbs1P35441 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Thbs1P35441 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thbs1P35441 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Thbs1P35441 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Thbs1P35441 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Thbs1P35441 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thbs1P35441 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Thbs1P35441 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Thbs1P35441 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms