Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa2P28309 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Defa2P28309 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Defa2P28309 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa2P28309 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa2P28309 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa2P28309 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa2P28309 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa2P28309 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa2P28309 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa2P28309 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa2P28309 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa2P28309 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa2P28309 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa2P28309 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa2P28309 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa2P28309 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa2P28309 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa2P28309 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa2P28309 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa2P28309 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa2P28309 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa2P28309 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa2P28309 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa2P28309 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa2P28309 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa2P28309 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa2P28309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa2P28309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa2P28309 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa2P28309 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa2P28309 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa2P28309 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa2P28309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa2P28309 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa2P28309 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa2P28309 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa2P28309 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa2P28309 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa2P28309 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa2P28309 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa2P28309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa2P28309 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa2P28309 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa2P28309 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa2P28309 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa2P28309 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa2P28309 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms