Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pou2f1P25425 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pou2f1P25425 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pou2f1P25425 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pou2f1P25425 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pou2f1P25425 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pou2f1P25425 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pou2f1P25425 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pou2f1P25425 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pou2f1P25425 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pou2f1P25425 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pou2f1P25425 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pou2f1P25425 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou2f1P25425 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pou2f1P25425 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou2f1P25425 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou2f1P25425 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou2f1P25425 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou2f1P25425 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pou2f1P25425 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou2f1P25425 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou2f1P25425 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou2f1P25425 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou2f1P25425 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou2f1P25425 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou2f1P25425 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou2f1P25425 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou2f1P25425 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou2f1P25425 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou2f1P25425 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou2f1P25425 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou2f1P25425 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pou2f1P25425 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou2f1P25425 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou2f1P25425 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou2f1P25425 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou2f1P25425 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou2f1P25425 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou2f1P25425 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou2f1P25425 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou2f1P25425 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou2f1P25425 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou2f1P25425 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou2f1P25425 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou2f1P25425 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou2f1P25425 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou2f1P25425 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou2f1P25425 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou2f1P25425 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou2f1P25425 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou2f1P25425 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou2f1P25425 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou2f1P25425 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou2f1P25425 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou2f1P25425 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou2f1P25425 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pou2f1P25425 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou2f1P25425 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou2f1P25425 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou2f1P25425 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou2f1P25425 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou2f1P25425 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou2f1P25425 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou2f1P25425 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou2f1P25425 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou2f1P25425 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pou2f1P25425 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou2f1P25425 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.2 ms