Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkcaP20444 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkcaP20444 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkcaP20444 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkcaP20444 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcaP20444 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkcaP20444 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkcaP20444 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkcaP20444 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PrkcaP20444 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PrkcaP20444 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcaP20444 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PrkcaP20444 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PrkcaP20444 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrkcaP20444 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrkcaP20444 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkcaP20444 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkcaP20444 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcaP20444 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkcaP20444 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PrkcaP20444 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkcaP20444 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcaP20444 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcaP20444 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcaP20444 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcaP20444 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcaP20444 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcaP20444 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcaP20444 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcaP20444 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcaP20444 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrkcaP20444 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcaP20444 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcaP20444 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcaP20444 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcaP20444 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcaP20444 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcaP20444 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcaP20444 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcaP20444 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcaP20444 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcaP20444 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcaP20444 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcaP20444 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcaP20444 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcaP20444 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcaP20444 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcaP20444 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcaP20444 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcaP20444 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcaP20444 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcaP20444 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcaP20444 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcaP20444 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcaP20444 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcaP20444 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcaP20444 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcaP20444 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcaP20444 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcaP20444 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcaP20444 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcaP20444 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcaP20444 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkcaP20444 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcaP20444 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcaP20444 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms