Protein–RNA interactions for Protein: P20060

Hexb, Beta-hexosaminidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexbP20060 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HexbP20060 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HexbP20060 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HexbP20060 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HexbP20060 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HexbP20060 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HexbP20060 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HexbP20060 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HexbP20060 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HexbP20060 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HexbP20060 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HexbP20060 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HexbP20060 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HexbP20060 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HexbP20060 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HexbP20060 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HexbP20060 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HexbP20060 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexbP20060 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HexbP20060 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HexbP20060 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HexbP20060 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HexbP20060 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HexbP20060 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HexbP20060 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HexbP20060 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HexbP20060 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HexbP20060 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HexbP20060 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HexbP20060 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HexbP20060 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HexbP20060 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HexbP20060 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HexbP20060 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HexbP20060 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HexbP20060 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HexbP20060 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HexbP20060 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HexbP20060 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HexbP20060 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HexbP20060 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HexbP20060 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HexbP20060 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HexbP20060 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HexbP20060 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HexbP20060 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HexbP20060 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HexbP20060 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HexbP20060 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HexbP20060 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HexbP20060 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HexbP20060 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HexbP20060 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HexbP20060 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HexbP20060 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HexbP20060 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HexbP20060 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HexbP20060 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HexbP20060 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HexbP20060 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HexbP20060 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HexbP20060 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HexbP20060 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HexbP20060 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HexbP20060 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HexbP20060 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HexbP20060 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HexbP20060 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HexbP20060 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HexbP20060 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HexbP20060 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HexbP20060 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HexbP20060 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HexbP20060 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexbP20060 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexbP20060 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexbP20060 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexbP20060 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexbP20060 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HexbP20060 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HexbP20060 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HexbP20060 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexbP20060 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexbP20060 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexbP20060 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexbP20060 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HexbP20060 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HexbP20060 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HexbP20060 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HexbP20060 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HexbP20060 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HexbP20060 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HexbP20060 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexbP20060 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexbP20060 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexbP20060 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HexbP20060 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HexbP20060 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HexbP20060 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HexbP20060 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms