Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rps6ka1P18653 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rps6ka1P18653 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rps6ka1P18653 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rps6ka1P18653 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rps6ka1P18653 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rps6ka1P18653 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rps6ka1P18653 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rps6ka1P18653 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rps6ka1P18653 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6ka1P18653 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka1P18653 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka1P18653 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6ka1P18653 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rps6ka1P18653 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rps6ka1P18653 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6ka1P18653 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rps6ka1P18653 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rps6ka1P18653 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka1P18653 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6ka1P18653 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka1P18653 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka1P18653 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka1P18653 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka1P18653 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka1P18653 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6ka1P18653 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6ka1P18653 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Rps6ka1P18653 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka1P18653 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6ka1P18653 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rps6ka1P18653 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6ka1P18653 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rps6ka1P18653 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rps6ka1P18653 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka1P18653 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6ka1P18653 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6ka1P18653 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka1P18653 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka1P18653 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka1P18653 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka1P18653 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka1P18653 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6ka1P18653 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka1P18653 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka1P18653 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka1P18653 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6ka1P18653 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka1P18653 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rps6ka1P18653 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka1P18653 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6ka1P18653 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rps6ka1P18653 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rps6ka1P18653 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6ka1P18653 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rps6ka1P18653 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rps6ka1P18653 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6ka1P18653 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rps6ka1P18653 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rps6ka1P18653 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6ka1P18653 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rps6ka1P18653 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rps6ka1P18653 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rps6ka1P18653 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6ka1P18653 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rps6ka1P18653 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rps6ka1P18653 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka1P18653 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6ka1P18653 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rps6ka1P18653 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6ka1P18653 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6ka1P18653 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rps6ka1P18653 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka1P18653 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka1P18653 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms