Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh2P15116 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh2P15116 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh2P15116 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh2P15116 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh2P15116 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh2P15116 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh2P15116 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh2P15116 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh2P15116 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdh2P15116 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh2P15116 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh2P15116 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh2P15116 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh2P15116 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh2P15116 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh2P15116 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh2P15116 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdh2P15116 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh2P15116 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdh2P15116 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdh2P15116 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh2P15116 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh2P15116 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh2P15116 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh2P15116 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh2P15116 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh2P15116 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh2P15116 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh2P15116 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh2P15116 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh2P15116 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh2P15116 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh2P15116 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh2P15116 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh2P15116 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdh2P15116 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh2P15116 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh2P15116 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh2P15116 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh2P15116 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh2P15116 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh2P15116 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh2P15116 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh2P15116 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh2P15116 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh2P15116 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh2P15116 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh2P15116 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh2P15116 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh2P15116 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh2P15116 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh2P15116 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh2P15116 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh2P15116 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh2P15116 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh2P15116 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms