Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TtrP07309 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TtrP07309 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtrP07309 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TtrP07309 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtrP07309 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtrP07309 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtrP07309 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtrP07309 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TtrP07309 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtrP07309 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtrP07309 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtrP07309 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TtrP07309 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtrP07309 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtrP07309 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TtrP07309 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtrP07309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TtrP07309 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TtrP07309 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtrP07309 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TtrP07309 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TtrP07309 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TtrP07309 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TtrP07309 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TtrP07309 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TtrP07309 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TtrP07309 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtrP07309 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TtrP07309 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtrP07309 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TtrP07309 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TtrP07309 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TtrP07309 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtrP07309 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TtrP07309 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtrP07309 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TtrP07309 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TtrP07309 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TtrP07309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TtrP07309 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TtrP07309 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TtrP07309 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TtrP07309 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TtrP07309 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TtrP07309 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TtrP07309 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtrP07309 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtrP07309 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtrP07309 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtrP07309 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtrP07309 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtrP07309 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtrP07309 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TtrP07309 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtrP07309 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtrP07309 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtrP07309 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TtrP07309 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtrP07309 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtrP07309 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtrP07309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtrP07309 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TtrP07309 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TtrP07309 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtrP07309 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtrP07309 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtrP07309 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtrP07309 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtrP07309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtrP07309 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtrP07309 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtrP07309 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtrP07309 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtrP07309 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtrP07309 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtrP07309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtrP07309 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtrP07309 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtrP07309 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtrP07309 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtrP07309 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtrP07309 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtrP07309 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtrP07309 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtrP07309 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtrP07309 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtrP07309 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtrP07309 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TtrP07309 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TtrP07309 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtrP07309 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtrP07309 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtrP07309 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TtrP07309 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtrP07309 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtrP07309 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtrP07309 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtrP07309 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtrP07309 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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