Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P06320 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P06320 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
P06320 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P06320 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06320 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P06320 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P06320 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06320 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P06320 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06320 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06320 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06320 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06320 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06320 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P06320 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P06320 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P06320 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P06320 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P06320 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P06320 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06320 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P06320 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P06320 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06320 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06320 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P06320 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P06320 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P06320 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06320 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06320 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06320 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06320 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P06320 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P06320 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P06320 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P06320 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P06320 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P06320 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P06320 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06320 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06320 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06320 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06320 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06320 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06320 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06320 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06320 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06320 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06320 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06320 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06320 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06320 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06320 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P06320 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06320 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P06320 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P06320 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P06320 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P06320 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06320 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06320 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06320 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06320 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06320 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06320 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06320 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06320 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06320 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06320 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06320 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06320 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06320 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06320 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06320 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P06320 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06320 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06320 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06320 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06320 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06320 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06320 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P06320 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06320 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06320 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06320 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06320 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06320 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06320 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06320 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06320 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06320 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06320 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06320 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06320 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06320 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06320 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06320 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06320 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06320 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms