Protein–RNA interactions for Protein: P01799

Ig heavy chain V-III region ABE-47N, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01799 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01799 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01799 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01799 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01799 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01799 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01799 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01799 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01799 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01799 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01799 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01799 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01799 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01799 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01799 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01799 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01799 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01799 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01799 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01799 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01799 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01799 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01799 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01799 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01799 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01799 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01799 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01799 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01799 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01799 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01799 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01799 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P01799 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01799 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01799 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01799 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01799 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01799 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01799 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01799 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01799 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01799 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01799 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01799 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01799 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01799 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01799 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01799 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01799 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01799 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01799 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01799 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01799 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01799 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01799 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01799 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01799 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01799 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01799 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01799 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01799 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01799 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01799 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01799 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P01799 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01799 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01799 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01799 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01799 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01799 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01799 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01799 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01799 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01799 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01799 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01799 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01799 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01799 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01799 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P01799 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01799 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01799 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01799 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P01799 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01799 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01799 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P01799 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01799 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01799 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P01799 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01799 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01799 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01799 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P01799 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P01799 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
P01799 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01799 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01799 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01799 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01799 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms