Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Alx3O70137 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Alx3O70137 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Alx3O70137 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Alx3O70137 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Alx3O70137 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Alx3O70137 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Alx3O70137 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Alx3O70137 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Alx3O70137 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Alx3O70137 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Alx3O70137 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx3O70137 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Alx3O70137 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Alx3O70137 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Alx3O70137 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Alx3O70137 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Alx3O70137 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Alx3O70137 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alx3O70137 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Alx3O70137 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Alx3O70137 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Alx3O70137 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Alx3O70137 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Alx3O70137 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Alx3O70137 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Alx3O70137 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx3O70137 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Alx3O70137 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Alx3O70137 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Alx3O70137 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Alx3O70137 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Alx3O70137 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alx3O70137 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Alx3O70137 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alx3O70137 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alx3O70137 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alx3O70137 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alx3O70137 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx3O70137 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alx3O70137 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alx3O70137 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alx3O70137 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Alx3O70137 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Alx3O70137 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Alx3O70137 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx3O70137 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx3O70137 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Alx3O70137 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Alx3O70137 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx3O70137 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx3O70137 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Alx3O70137 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Alx3O70137 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Alx3O70137 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Alx3O70137 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Alx3O70137 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Alx3O70137 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Alx3O70137 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Alx3O70137 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Alx3O70137 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Alx3O70137 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Alx3O70137 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alx3O70137 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alx3O70137 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Alx3O70137 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Alx3O70137 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms