Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Banf1O54962 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Banf1O54962 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Banf1O54962 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Banf1O54962 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Banf1O54962 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Banf1O54962 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Banf1O54962 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Banf1O54962 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Banf1O54962 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Banf1O54962 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Banf1O54962 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Banf1O54962 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Banf1O54962 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Banf1O54962 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Banf1O54962 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Banf1O54962 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Banf1O54962 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Banf1O54962 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Banf1O54962 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Banf1O54962 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Banf1O54962 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Banf1O54962 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Banf1O54962 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Banf1O54962 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Banf1O54962 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Banf1O54962 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Banf1O54962 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Banf1O54962 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Banf1O54962 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Banf1O54962 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Banf1O54962 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Banf1O54962 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Banf1O54962 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Banf1O54962 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Banf1O54962 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Banf1O54962 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Banf1O54962 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Banf1O54962 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Banf1O54962 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Banf1O54962 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Banf1O54962 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Banf1O54962 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Banf1O54962 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Banf1O54962 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Banf1O54962 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Banf1O54962 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Banf1O54962 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Banf1O54962 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Banf1O54962 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Banf1O54962 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Banf1O54962 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Banf1O54962 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Banf1O54962 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Banf1O54962 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Banf1O54962 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Banf1O54962 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Banf1O54962 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Banf1O54962 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Banf1O54962 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Banf1O54962 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Banf1O54962 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Banf1O54962 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Banf1O54962 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Banf1O54962 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Banf1O54962 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Banf1O54962 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Banf1O54962 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Banf1O54962 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Banf1O54962 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Banf1O54962 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Banf1O54962 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Banf1O54962 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Banf1O54962 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Banf1O54962 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Banf1O54962 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Banf1O54962 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms