Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lgals6O54891 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lgals6O54891 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lgals6O54891 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lgals6O54891 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lgals6O54891 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lgals6O54891 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lgals6O54891 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lgals6O54891 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lgals6O54891 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lgals6O54891 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lgals6O54891 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lgals6O54891 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lgals6O54891 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lgals6O54891 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lgals6O54891 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lgals6O54891 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lgals6O54891 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lgals6O54891 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lgals6O54891 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lgals6O54891 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lgals6O54891 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lgals6O54891 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lgals6O54891 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lgals6O54891 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgals6O54891 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lgals6O54891 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lgals6O54891 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgals6O54891 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lgals6O54891 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgals6O54891 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgals6O54891 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lgals6O54891 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lgals6O54891 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lgals6O54891 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lgals6O54891 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lgals6O54891 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lgals6O54891 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lgals6O54891 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lgals6O54891 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lgals6O54891 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms