Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcns1O35173 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcns1O35173 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcns1O35173 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcns1O35173 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcns1O35173 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcns1O35173 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcns1O35173 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcns1O35173 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcns1O35173 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcns1O35173 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcns1O35173 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcns1O35173 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcns1O35173 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcns1O35173 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcns1O35173 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcns1O35173 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcns1O35173 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kcns1O35173 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcns1O35173 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcns1O35173 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcns1O35173 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcns1O35173 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcns1O35173 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcns1O35173 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcns1O35173 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcns1O35173 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcns1O35173 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcns1O35173 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcns1O35173 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcns1O35173 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcns1O35173 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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