Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hps1O08983 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hps1O08983 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hps1O08983 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hps1O08983 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps1O08983 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps1O08983 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps1O08983 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps1O08983 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps1O08983 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hps1O08983 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hps1O08983 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hps1O08983 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hps1O08983 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hps1O08983 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps1O08983 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps1O08983 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps1O08983 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps1O08983 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps1O08983 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps1O08983 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps1O08983 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hps1O08983 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hps1O08983 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hps1O08983 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hps1O08983 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hps1O08983 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps1O08983 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps1O08983 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps1O08983 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps1O08983 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps1O08983 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps1O08983 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps1O08983 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hps1O08983 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hps1O08983 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hps1O08983 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hps1O08983 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms