Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Eftud2O08810 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Eftud2O08810 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Eftud2O08810 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Eftud2O08810 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Eftud2O08810 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Eftud2O08810 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eftud2O08810 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Eftud2O08810 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eftud2O08810 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eftud2O08810 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Eftud2O08810 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Eftud2O08810 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eftud2O08810 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eftud2O08810 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Eftud2O08810 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eftud2O08810 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eftud2O08810 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eftud2O08810 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Eftud2O08810 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Eftud2O08810 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eftud2O08810 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eftud2O08810 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eftud2O08810 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eftud2O08810 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eftud2O08810 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eftud2O08810 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Eftud2O08810 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eftud2O08810 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eftud2O08810 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eftud2O08810 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Eftud2O08810 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eftud2O08810 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eftud2O08810 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Eftud2O08810 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eftud2O08810 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eftud2O08810 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eftud2O08810 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Eftud2O08810 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Eftud2O08810 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eftud2O08810 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eftud2O08810 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Eftud2O08810 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Eftud2O08810 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Eftud2O08810 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Eftud2O08810 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eftud2O08810 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eftud2O08810 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eftud2O08810 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eftud2O08810 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eftud2O08810 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eftud2O08810 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eftud2O08810 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eftud2O08810 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eftud2O08810 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eftud2O08810 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eftud2O08810 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Eftud2O08810 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eftud2O08810 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eftud2O08810 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eftud2O08810 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eftud2O08810 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Eftud2O08810 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eftud2O08810 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Eftud2O08810 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Eftud2O08810 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Eftud2O08810 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Eftud2O08810 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Eftud2O08810 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Eftud2O08810 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Eftud2O08810 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eftud2O08810 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Eftud2O08810 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Eftud2O08810 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Eftud2O08810 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Eftud2O08810 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eftud2O08810 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Eftud2O08810 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eftud2O08810 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms