Protein–RNA interactions for Protein: L7N2A2

Gm8906, Predicted gene 8906 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8906L7N2A2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm8906L7N2A2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm8906L7N2A2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm8906L7N2A2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm8906L7N2A2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm8906L7N2A2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm8906L7N2A2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm8906L7N2A2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm8906L7N2A2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm8906L7N2A2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm8906L7N2A2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8906L7N2A2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm8906L7N2A2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm8906L7N2A2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8906L7N2A2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8906L7N2A2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8906L7N2A2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8906L7N2A2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8906L7N2A2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm8906L7N2A2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm8906L7N2A2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8906L7N2A2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm8906L7N2A2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm8906L7N2A2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8906L7N2A2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8906L7N2A2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8906L7N2A2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8906L7N2A2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8906L7N2A2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8906L7N2A2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8906L7N2A2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8906L7N2A2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8906L7N2A2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8906L7N2A2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8906L7N2A2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm8906L7N2A2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm8906L7N2A2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm8906L7N2A2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8906L7N2A2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8906L7N2A2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8906L7N2A2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm8906L7N2A2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm8906L7N2A2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8906L7N2A2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8906L7N2A2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8906L7N2A2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm8906L7N2A2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm8906L7N2A2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm8906L7N2A2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm8906L7N2A2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm8906L7N2A2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8906L7N2A2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm8906L7N2A2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm8906L7N2A2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm8906L7N2A2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm8906L7N2A2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm8906L7N2A2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm8906L7N2A2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm8906L7N2A2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm8906L7N2A2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm8906L7N2A2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm8906L7N2A2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm8906L7N2A2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm8906L7N2A2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm8906L7N2A2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8906L7N2A2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8906L7N2A2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8906L7N2A2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8906L7N2A2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8906L7N2A2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8906L7N2A2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8906L7N2A2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8906L7N2A2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8906L7N2A2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8906L7N2A2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8906L7N2A2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8906L7N2A2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8906L7N2A2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms