Protein–RNA interactions for Protein: L7N229

Gm4778, Predicted gene 4778, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4778L7N229 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4778L7N229 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4778L7N229 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4778L7N229 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4778L7N229 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4778L7N229 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4778L7N229 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4778L7N229 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4778L7N229 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4778L7N229 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4778L7N229 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm4778L7N229 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm4778L7N229 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4778L7N229 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4778L7N229 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm4778L7N229 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4778L7N229 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm4778L7N229 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4778L7N229 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4778L7N229 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4778L7N229 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4778L7N229 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4778L7N229 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4778L7N229 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4778L7N229 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm4778L7N229 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm4778L7N229 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm4778L7N229 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm4778L7N229 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm4778L7N229 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm4778L7N229 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm4778L7N229 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4778L7N229 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm4778L7N229 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm4778L7N229 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm4778L7N229 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm4778L7N229 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm4778L7N229 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4778L7N229 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4778L7N229 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4778L7N229 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4778L7N229 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4778L7N229 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm4778L7N229 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4778L7N229 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4778L7N229 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4778L7N229 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4778L7N229 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4778L7N229 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm4778L7N229 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4778L7N229 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4778L7N229 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm4778L7N229 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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