Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm28051J3QMA2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28051J3QMA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28051J3QMA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm28051J3QMA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm28051J3QMA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm28051J3QMA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm28051J3QMA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28051J3QMA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28051J3QMA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28051J3QMA2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28051J3QMA2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28051J3QMA2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28051J3QMA2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28051J3QMA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28051J3QMA2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28051J3QMA2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28051J3QMA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28051J3QMA2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28051J3QMA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28051J3QMA2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28051J3QMA2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28051J3QMA2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28051J3QMA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28051J3QMA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28051J3QMA2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28051J3QMA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28051J3QMA2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28051J3QMA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28051J3QMA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28051J3QMA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28051J3QMA2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm28051J3QMA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28051J3QMA2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28051J3QMA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28051J3QMA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms