Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
4933406M09RikG3XA12 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
4933406M09RikG3XA12 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4933406M09RikG3XA12 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4933406M09RikG3XA12 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4933406M09RikG3XA12 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
4933406M09RikG3XA12 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4933406M09RikG3XA12 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4933406M09RikG3XA12 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4933406M09RikG3XA12 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
4933406M09RikG3XA12 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4933406M09RikG3XA12 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4933406M09RikG3XA12 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
4933406M09RikG3XA12 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4933406M09RikG3XA12 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
4933406M09RikG3XA12 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
4933406M09RikG3XA12 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4933406M09RikG3XA12 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4933406M09RikG3XA12 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
4933406M09RikG3XA12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
4933406M09RikG3XA12 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
4933406M09RikG3XA12 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
4933406M09RikG3XA12 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
4933406M09RikG3XA12 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
4933406M09RikG3XA12 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
4933406M09RikG3XA12 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
4933406M09RikG3XA12 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
4933406M09RikG3XA12 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
4933406M09RikG3XA12 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
4933406M09RikG3XA12 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4933406M09RikG3XA12 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4933406M09RikG3XA12 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
4933406M09RikG3XA12 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
4933406M09RikG3XA12 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4933406M09RikG3XA12 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
4933406M09RikG3XA12 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
4933406M09RikG3XA12 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
4933406M09RikG3XA12 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
4933406M09RikG3XA12 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
4933406M09RikG3XA12 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
4933406M09RikG3XA12 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
4933406M09RikG3XA12 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
4933406M09RikG3XA12 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
4933406M09RikG3XA12 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
4933406M09RikG3XA12 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
4933406M09RikG3XA12 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
4933406M09RikG3XA12 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
4933406M09RikG3XA12 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
4933406M09RikG3XA12 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
4933406M09RikG3XA12 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4933406M09RikG3XA12 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
4933406M09RikG3XA12 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4933406M09RikG3XA12 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4933406M09RikG3XA12 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4933406M09RikG3XA12 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4933406M09RikG3XA12 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4933406M09RikG3XA12 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4933406M09RikG3XA12 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933406M09RikG3XA12 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933406M09RikG3XA12 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
4933406M09RikG3XA12 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4933406M09RikG3XA12 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4933406M09RikG3XA12 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
4933406M09RikG3XA12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4933406M09RikG3XA12 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4933406M09RikG3XA12 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933406M09RikG3XA12 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4933406M09RikG3XA12 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
4933406M09RikG3XA12 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933406M09RikG3XA12 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933406M09RikG3XA12 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4933406M09RikG3XA12 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933406M09RikG3XA12 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933406M09RikG3XA12 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
4933406M09RikG3XA12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
4933406M09RikG3XA12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
4933406M09RikG3XA12 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
4933406M09RikG3XA12 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
4933406M09RikG3XA12 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
4933406M09RikG3XA12 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4933406M09RikG3XA12 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933406M09RikG3XA12 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933406M09RikG3XA12 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4933406M09RikG3XA12 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
4933406M09RikG3XA12 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
4933406M09RikG3XA12 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
4933406M09RikG3XA12 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms