Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r58G3X9U3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r58G3X9U3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r58G3X9U3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r58G3X9U3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r58G3X9U3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r58G3X9U3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r58G3X9U3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r58G3X9U3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r58G3X9U3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r58G3X9U3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r58G3X9U3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r58G3X9U3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r58G3X9U3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r58G3X9U3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r58G3X9U3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r58G3X9U3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r58G3X9U3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r58G3X9U3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r58G3X9U3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r58G3X9U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r58G3X9U3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r58G3X9U3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r58G3X9U3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r58G3X9U3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r58G3X9U3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r58G3X9U3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r58G3X9U3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r58G3X9U3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r58G3X9U3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r58G3X9U3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r58G3X9U3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r58G3X9U3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r58G3X9U3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r58G3X9U3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r58G3X9U3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r58G3X9U3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r58G3X9U3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r58G3X9U3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r58G3X9U3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r58G3X9U3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r58G3X9U3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r58G3X9U3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r58G3X9U3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r58G3X9U3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms