Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zkscan2G3X952 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zkscan2G3X952 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Zkscan2G3X952 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Zkscan2G3X952 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Zkscan2G3X952 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Zkscan2G3X952 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Zkscan2G3X952 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Zkscan2G3X952 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Zkscan2G3X952 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Zkscan2G3X952 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Zkscan2G3X952 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Zkscan2G3X952 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Zkscan2G3X952 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Zkscan2G3X952 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Zkscan2G3X952 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Zkscan2G3X952 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Zkscan2G3X952 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Zkscan2G3X952 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Zkscan2G3X952 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Zkscan2G3X952 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Zkscan2G3X952 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Zkscan2G3X952 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Zkscan2G3X952 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Zkscan2G3X952 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Zkscan2G3X952 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Zkscan2G3X952 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Zkscan2G3X952 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Zkscan2G3X952 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Zkscan2G3X952 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Zkscan2G3X952 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Zkscan2G3X952 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Zkscan2G3X952 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Zkscan2G3X952 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Zkscan2G3X952 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Zkscan2G3X952 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Zkscan2G3X952 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Zkscan2G3X952 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Zkscan2G3X952 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Zkscan2G3X952 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Zkscan2G3X952 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Zkscan2G3X952 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Zkscan2G3X952 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Zkscan2G3X952 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Zkscan2G3X952 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Zkscan2G3X952 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Zkscan2G3X952 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Zkscan2G3X952 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Zkscan2G3X952 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Zkscan2G3X952 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Zkscan2G3X952 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Zkscan2G3X952 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Zkscan2G3X952 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Zkscan2G3X952 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Zkscan2G3X952 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Zkscan2G3X952 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Zkscan2G3X952 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Zkscan2G3X952 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Zkscan2G3X952 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Zkscan2G3X952 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Zkscan2G3X952 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Zkscan2G3X952 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Zkscan2G3X952 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Zkscan2G3X952 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Zkscan2G3X952 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Zkscan2G3X952 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Zkscan2G3X952 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Zkscan2G3X952 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Zkscan2G3X952 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Zkscan2G3X952 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Zkscan2G3X952 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Zkscan2G3X952 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Zkscan2G3X952 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Zkscan2G3X952 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Zkscan2G3X952 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Zkscan2G3X952 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Zkscan2G3X952 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Zkscan2G3X952 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Zkscan2G3X952 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Zkscan2G3X952 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Zkscan2G3X952 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Zkscan2G3X952 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Zkscan2G3X952 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Zkscan2G3X952 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Zkscan2G3X952 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Zkscan2G3X952 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Zkscan2G3X952 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Zkscan2G3X952 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Zkscan2G3X952 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Zkscan2G3X952 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Zkscan2G3X952 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Zkscan2G3X952 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Zkscan2G3X952 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Zkscan2G3X952 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms