Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20604F8WIA3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20604F8WIA3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20604F8WIA3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20604F8WIA3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20604F8WIA3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20604F8WIA3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20604F8WIA3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20604F8WIA3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20604F8WIA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20604F8WIA3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20604F8WIA3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20604F8WIA3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20604F8WIA3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20604F8WIA3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20604F8WIA3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20604F8WIA3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20604F8WIA3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20604F8WIA3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20604F8WIA3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20604F8WIA3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20604F8WIA3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20604F8WIA3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20604F8WIA3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20604F8WIA3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20604F8WIA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20604F8WIA3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20604F8WIA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20604F8WIA3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20604F8WIA3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms