Protein–RNA interactions for Protein: F6QEY5

Gm10197, Predicted gene 10197, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10197F6QEY5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10197F6QEY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm10197F6QEY5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm10197F6QEY5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10197F6QEY5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10197F6QEY5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10197F6QEY5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm10197F6QEY5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10197F6QEY5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10197F6QEY5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10197F6QEY5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10197F6QEY5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10197F6QEY5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm10197F6QEY5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10197F6QEY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10197F6QEY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10197F6QEY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10197F6QEY5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm10197F6QEY5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10197F6QEY5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10197F6QEY5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm10197F6QEY5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10197F6QEY5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10197F6QEY5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10197F6QEY5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10197F6QEY5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10197F6QEY5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms