Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krtap11-1E9Q2E9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krtap11-1E9Q2E9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krtap11-1E9Q2E9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krtap11-1E9Q2E9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krtap11-1E9Q2E9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krtap11-1E9Q2E9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krtap11-1E9Q2E9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krtap11-1E9Q2E9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krtap11-1E9Q2E9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krtap11-1E9Q2E9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krtap11-1E9Q2E9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap11-1E9Q2E9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap11-1E9Q2E9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap11-1E9Q2E9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap11-1E9Q2E9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krtap11-1E9Q2E9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krtap11-1E9Q2E9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krtap11-1E9Q2E9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krtap11-1E9Q2E9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krtap11-1E9Q2E9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krtap11-1E9Q2E9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krtap11-1E9Q2E9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krtap11-1E9Q2E9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krtap11-1E9Q2E9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap11-1E9Q2E9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krtap11-1E9Q2E9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krtap11-1E9Q2E9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krtap11-1E9Q2E9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krtap11-1E9Q2E9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krtap11-1E9Q2E9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krtap11-1E9Q2E9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krtap11-1E9Q2E9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krtap11-1E9Q2E9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213 ms