Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rsph10bE9PYQ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rsph10bE9PYQ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rsph10bE9PYQ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rsph10bE9PYQ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rsph10bE9PYQ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rsph10bE9PYQ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rsph10bE9PYQ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rsph10bE9PYQ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rsph10bE9PYQ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rsph10bE9PYQ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rsph10bE9PYQ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rsph10bE9PYQ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rsph10bE9PYQ0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rsph10bE9PYQ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rsph10bE9PYQ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rsph10bE9PYQ0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rsph10bE9PYQ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph10bE9PYQ0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph10bE9PYQ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Rsph10bE9PYQ0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsph10bE9PYQ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rsph10bE9PYQ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rsph10bE9PYQ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rsph10bE9PYQ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rsph10bE9PYQ0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rsph10bE9PYQ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rsph10bE9PYQ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rsph10bE9PYQ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rsph10bE9PYQ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rsph10bE9PYQ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rsph10bE9PYQ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rsph10bE9PYQ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rsph10bE9PYQ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rsph10bE9PYQ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rsph10bE9PYQ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rsph10bE9PYQ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rsph10bE9PYQ0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rsph10bE9PYQ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rsph10bE9PYQ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rsph10bE9PYQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rsph10bE9PYQ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rsph10bE9PYQ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rsph10bE9PYQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rsph10bE9PYQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rsph10bE9PYQ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rsph10bE9PYQ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rsph10bE9PYQ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rsph10bE9PYQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rsph10bE9PYQ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rsph10bE9PYQ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rsph10bE9PYQ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsph10bE9PYQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rsph10bE9PYQ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsph10bE9PYQ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsph10bE9PYQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsph10bE9PYQ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rsph10bE9PYQ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsph10bE9PYQ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsph10bE9PYQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsph10bE9PYQ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rsph10bE9PYQ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsph10bE9PYQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms