Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm10110D3Z5M2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm10110D3Z5M2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm10110D3Z5M2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Gm10110D3Z5M2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gm10110D3Z5M2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gm10110D3Z5M2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gm10110D3Z5M2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gm10110D3Z5M2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gm10110D3Z5M2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gm10110D3Z5M2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Gm10110D3Z5M2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gm10110D3Z5M2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm10110D3Z5M2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gm10110D3Z5M2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gm10110D3Z5M2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gm10110D3Z5M2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gm10110D3Z5M2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gm10110D3Z5M2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gm10110D3Z5M2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gm10110D3Z5M2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm10110D3Z5M2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gm10110D3Z5M2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm10110D3Z5M2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gm10110D3Z5M2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm10110D3Z5M2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gm10110D3Z5M2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gm10110D3Z5M2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm10110D3Z5M2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gm10110D3Z5M2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gm10110D3Z5M2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm10110D3Z5M2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gm10110D3Z5M2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm10110D3Z5M2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm10110D3Z5M2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gm10110D3Z5M2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gm10110D3Z5M2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm10110D3Z5M2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gm10110D3Z5M2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gm10110D3Z5M2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gm10110D3Z5M2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gm10110D3Z5M2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gm10110D3Z5M2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm10110D3Z5M2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm10110D3Z5M2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm10110D3Z5M2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm10110D3Z5M2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm10110D3Z5M2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm10110D3Z5M2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm10110D3Z5M2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm10110D3Z5M2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm10110D3Z5M2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm10110D3Z5M2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm10110D3Z5M2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm10110D3Z5M2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm10110D3Z5M2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm10110D3Z5M2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm10110D3Z5M2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10110D3Z5M2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm10110D3Z5M2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm10110D3Z5M2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm10110D3Z5M2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm10110D3Z5M2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10110D3Z5M2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm10110D3Z5M2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10110D3Z5M2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm10110D3Z5M2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm10110D3Z5M2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm10110D3Z5M2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm10110D3Z5M2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm10110D3Z5M2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm10110D3Z5M2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm10110D3Z5M2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm10110D3Z5M2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm10110D3Z5M2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm10110D3Z5M2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm10110D3Z5M2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm10110D3Z5M2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm10110D3Z5M2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm10110D3Z5M2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm10110D3Z5M2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm10110D3Z5M2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms