Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem200bD3Z0P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem200bD3Z0P8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem200bD3Z0P8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem200bD3Z0P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem200bD3Z0P8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem200bD3Z0P8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem200bD3Z0P8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem200bD3Z0P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem200bD3Z0P8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem200bD3Z0P8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem200bD3Z0P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem200bD3Z0P8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem200bD3Z0P8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem200bD3Z0P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem200bD3Z0P8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem200bD3Z0P8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem200bD3Z0P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem200bD3Z0P8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem200bD3Z0P8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem200bD3Z0P8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200bD3Z0P8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200bD3Z0P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200bD3Z0P8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem200bD3Z0P8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem200bD3Z0P8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem200bD3Z0P8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem200bD3Z0P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem200bD3Z0P8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem200bD3Z0P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem200bD3Z0P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem200bD3Z0P8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem200bD3Z0P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem200bD3Z0P8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem200bD3Z0P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem200bD3Z0P8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem200bD3Z0P8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem200bD3Z0P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem200bD3Z0P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem200bD3Z0P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem200bD3Z0P8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem200bD3Z0P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem200bD3Z0P8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem200bD3Z0P8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem200bD3Z0P8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem200bD3Z0P8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem200bD3Z0P8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem200bD3Z0P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem200bD3Z0P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem200bD3Z0P8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem200bD3Z0P8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem200bD3Z0P8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem200bD3Z0P8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem200bD3Z0P8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem200bD3Z0P8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms