Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930444P10RikD3YUR1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930444P10RikD3YUR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930444P10RikD3YUR1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930444P10RikD3YUR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930444P10RikD3YUR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930444P10RikD3YUR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930444P10RikD3YUR1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930444P10RikD3YUR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930444P10RikD3YUR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930444P10RikD3YUR1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930444P10RikD3YUR1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930444P10RikD3YUR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930444P10RikD3YUR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930444P10RikD3YUR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930444P10RikD3YUR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930444P10RikD3YUR1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930444P10RikD3YUR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930444P10RikD3YUR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930444P10RikD3YUR1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930444P10RikD3YUR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930444P10RikD3YUR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930444P10RikD3YUR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21■□□□□ 0.95
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930444P10RikD3YUR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930444P10RikD3YUR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930444P10RikD3YUR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930444P10RikD3YUR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
4930444P10RikD3YUR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930444P10RikD3YUR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930444P10RikD3YUR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930444P10RikD3YUR1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930444P10RikD3YUR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930444P10RikD3YUR1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930444P10RikD3YUR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930444P10RikD3YUR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
4930444P10RikD3YUR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4930444P10RikD3YUR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930444P10RikD3YUR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930444P10RikD3YUR1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930444P10RikD3YUR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930444P10RikD3YUR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930444P10RikD3YUR1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930444P10RikD3YUR1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930444P10RikD3YUR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930444P10RikD3YUR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms