Protein–RNA interactions for Protein: D2EAC2

Zbed6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed6D2EAC2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed6D2EAC2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed6D2EAC2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbed6D2EAC2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed6D2EAC2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zbed6D2EAC2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbed6D2EAC2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed6D2EAC2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbed6D2EAC2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbed6D2EAC2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbed6D2EAC2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbed6D2EAC2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zbed6D2EAC2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zbed6D2EAC2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zbed6D2EAC2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zbed6D2EAC2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed6D2EAC2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zbed6D2EAC2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zbed6D2EAC2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zbed6D2EAC2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zbed6D2EAC2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zbed6D2EAC2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zbed6D2EAC2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbed6D2EAC2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed6D2EAC2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbed6D2EAC2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbed6D2EAC2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbed6D2EAC2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbed6D2EAC2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbed6D2EAC2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbed6D2EAC2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed6D2EAC2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed6D2EAC2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed6D2EAC2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbed6D2EAC2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed6D2EAC2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbed6D2EAC2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbed6D2EAC2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbed6D2EAC2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbed6D2EAC2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbed6D2EAC2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed6D2EAC2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed6D2EAC2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbed6D2EAC2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbed6D2EAC2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbed6D2EAC2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed6D2EAC2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed6D2EAC2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbed6D2EAC2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbed6D2EAC2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed6D2EAC2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed6D2EAC2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed6D2EAC2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed6D2EAC2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed6D2EAC2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed6D2EAC2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed6D2EAC2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbed6D2EAC2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed6D2EAC2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbed6D2EAC2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed6D2EAC2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed6D2EAC2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed6D2EAC2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Zbed6D2EAC2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zbed6D2EAC2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbed6D2EAC2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zbed6D2EAC2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbed6D2EAC2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbed6D2EAC2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbed6D2EAC2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbed6D2EAC2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbed6D2EAC2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbed6D2EAC2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbed6D2EAC2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbed6D2EAC2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbed6D2EAC2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbed6D2EAC2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbed6D2EAC2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zbed6D2EAC2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbed6D2EAC2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbed6D2EAC2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zbed6D2EAC2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms