Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd8B9EJ80 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd8B9EJ80 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd8B9EJ80 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd8B9EJ80 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd8B9EJ80 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd8B9EJ80 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd8B9EJ80 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd8B9EJ80 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd8B9EJ80 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd8B9EJ80 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd8B9EJ80 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd8B9EJ80 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd8B9EJ80 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdzd8B9EJ80 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd8B9EJ80 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdzd8B9EJ80 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd8B9EJ80 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzd8B9EJ80 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzd8B9EJ80 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzd8B9EJ80 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzd8B9EJ80 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzd8B9EJ80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd8B9EJ80 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzd8B9EJ80 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzd8B9EJ80 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd8B9EJ80 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdzd8B9EJ80 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzd8B9EJ80 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzd8B9EJ80 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzd8B9EJ80 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd8B9EJ80 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzd8B9EJ80 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd8B9EJ80 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzd8B9EJ80 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzd8B9EJ80 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzd8B9EJ80 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzd8B9EJ80 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzd8B9EJ80 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzd8B9EJ80 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzd8B9EJ80 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd8B9EJ80 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd8B9EJ80 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd8B9EJ80 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd8B9EJ80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzd8B9EJ80 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd8B9EJ80 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzd8B9EJ80 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzd8B9EJ80 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd8B9EJ80 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd8B9EJ80 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd8B9EJ80 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd8B9EJ80 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd8B9EJ80 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd8B9EJ80 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd8B9EJ80 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd8B9EJ80 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd8B9EJ80 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd8B9EJ80 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd8B9EJ80 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd8B9EJ80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd8B9EJ80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms