Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsg1A2A825 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsg1A2A825 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsg1A2A825 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsg1A2A825 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsg1A2A825 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsg1A2A825 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsg1A2A825 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsg1A2A825 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsg1A2A825 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsg1A2A825 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsg1A2A825 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsg1A2A825 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsg1A2A825 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rsg1A2A825 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsg1A2A825 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsg1A2A825 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsg1A2A825 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsg1A2A825 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsg1A2A825 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsg1A2A825 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsg1A2A825 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsg1A2A825 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsg1A2A825 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsg1A2A825 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsg1A2A825 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsg1A2A825 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsg1A2A825 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsg1A2A825 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsg1A2A825 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsg1A2A825 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsg1A2A825 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsg1A2A825 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsg1A2A825 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsg1A2A825 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsg1A2A825 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsg1A2A825 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rsg1A2A825 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rsg1A2A825 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsg1A2A825 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsg1A2A825 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsg1A2A825 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsg1A2A825 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsg1A2A825 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rsg1A2A825 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rsg1A2A825 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rsg1A2A825 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rsg1A2A825 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsg1A2A825 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsg1A2A825 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsg1A2A825 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsg1A2A825 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsg1A2A825 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsg1A2A825 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsg1A2A825 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsg1A2A825 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms