Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trav12-2A0N8N6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trav12-2A0N8N6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trav12-2A0N8N6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trav12-2A0N8N6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trav12-2A0N8N6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trav12-2A0N8N6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trav12-2A0N8N6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trav12-2A0N8N6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trav12-2A0N8N6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trav12-2A0N8N6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trav12-2A0N8N6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav12-2A0N8N6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav12-2A0N8N6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav12-2A0N8N6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trav12-2A0N8N6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trav12-2A0N8N6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav12-2A0N8N6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav12-2A0N8N6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trav12-2A0N8N6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trav12-2A0N8N6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trav12-2A0N8N6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav12-2A0N8N6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav12-2A0N8N6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trav12-2A0N8N6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trav12-2A0N8N6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trav12-2A0N8N6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trav12-2A0N8N6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trav12-2A0N8N6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trav12-2A0N8N6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trav12-2A0N8N6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trav12-2A0N8N6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trav12-2A0N8N6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trav12-2A0N8N6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trav12-2A0N8N6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trav12-2A0N8N6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trav12-2A0N8N6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav12-2A0N8N6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav12-2A0N8N6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav12-2A0N8N6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav12-2A0N8N6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trav12-2A0N8N6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trav12-2A0N8N6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trav12-2A0N8N6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trav12-2A0N8N6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trav12-2A0N8N6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trav12-2A0N8N6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trav12-2A0N8N6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trav12-2A0N8N6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trav12-2A0N8N6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trav12-2A0N8N6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trav12-2A0N8N6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trav12-2A0N8N6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trav12-2A0N8N6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trav12-2A0N8N6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trav12-2A0N8N6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trav12-2A0N8N6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trav12-2A0N8N6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trav12-2A0N8N6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trav12-2A0N8N6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trav12-2A0N8N6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trav12-2A0N8N6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trav12-2A0N8N6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trav12-2A0N8N6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trav12-2A0N8N6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trav12-2A0N8N6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trav12-2A0N8N6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trav12-2A0N8N6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trav12-2A0N8N6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trav12-2A0N8N6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trav12-2A0N8N6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trav12-2A0N8N6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trav12-2A0N8N6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trav12-2A0N8N6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms