Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc173A0JLY1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc173A0JLY1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Ccdc173A0JLY1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc173A0JLY1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc173A0JLY1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc173A0JLY1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ccdc173A0JLY1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccdc173A0JLY1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc173A0JLY1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccdc173A0JLY1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc173A0JLY1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc173A0JLY1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc173A0JLY1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc173A0JLY1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc173A0JLY1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc173A0JLY1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc173A0JLY1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc173A0JLY1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc173A0JLY1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc173A0JLY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc173A0JLY1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc173A0JLY1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc173A0JLY1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc173A0JLY1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc173A0JLY1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc173A0JLY1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccdc173A0JLY1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc173A0JLY1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc173A0JLY1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc173A0JLY1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ccdc173A0JLY1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc173A0JLY1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc173A0JLY1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccdc173A0JLY1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc173A0JLY1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccdc173A0JLY1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc173A0JLY1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc173A0JLY1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc173A0JLY1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccdc173A0JLY1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc173A0JLY1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc173A0JLY1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc173A0JLY1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc173A0JLY1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccdc173A0JLY1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc173A0JLY1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc173A0JLY1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc173A0JLY1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc173A0JLY1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ccdc173A0JLY1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc173A0JLY1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc173A0JLY1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc173A0JLY1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccdc173A0JLY1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc173A0JLY1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc173A0JLY1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc173A0JLY1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc173A0JLY1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc173A0JLY1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc173A0JLY1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc173A0JLY1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc173A0JLY1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc173A0JLY1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc173A0JLY1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc173A0JLY1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc173A0JLY1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc173A0JLY1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ccdc173A0JLY1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc173A0JLY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc173A0JLY1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc173A0JLY1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc173A0JLY1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc173A0JLY1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc173A0JLY1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc173A0JLY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc173A0JLY1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc173A0JLY1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc173A0JLY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms