Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv5A0A0B4J1G9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbv5A0A0B4J1G9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv5A0A0B4J1G9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv5A0A0B4J1G9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv5A0A0B4J1G9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv5A0A0B4J1G9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv5A0A0B4J1G9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv5A0A0B4J1G9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trbv5A0A0B4J1G9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv5A0A0B4J1G9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv5A0A0B4J1G9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv5A0A0B4J1G9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv5A0A0B4J1G9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv5A0A0B4J1G9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv5A0A0B4J1G9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv5A0A0B4J1G9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv5A0A0B4J1G9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv5A0A0B4J1G9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv5A0A0B4J1G9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv5A0A0B4J1G9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trbv5A0A0B4J1G9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trbv5A0A0B4J1G9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv5A0A0B4J1G9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trbv5A0A0B4J1G9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trbv5A0A0B4J1G9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv5A0A0B4J1G9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv5A0A0B4J1G9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv5A0A0B4J1G9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trbv5A0A0B4J1G9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv5A0A0B4J1G9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trbv5A0A0B4J1G9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trbv5A0A0B4J1G9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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