Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW38

Gm28870, Predicted gene 28870, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28870A0A0A6YW38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm28870A0A0A6YW38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm28870A0A0A6YW38 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm28870A0A0A6YW38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28870A0A0A6YW38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28870A0A0A6YW38 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm28870A0A0A6YW38 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm28870A0A0A6YW38 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm28870A0A0A6YW38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm28870A0A0A6YW38 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm28870A0A0A6YW38 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28870A0A0A6YW38 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm28870A0A0A6YW38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm28870A0A0A6YW38 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm28870A0A0A6YW38 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28870A0A0A6YW38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28870A0A0A6YW38 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28870A0A0A6YW38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28870A0A0A6YW38 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28870A0A0A6YW38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28870A0A0A6YW38 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28870A0A0A6YW38 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28870A0A0A6YW38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28870A0A0A6YW38 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28870A0A0A6YW38 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28870A0A0A6YW38 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28870A0A0A6YW38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28870A0A0A6YW38 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28870A0A0A6YW38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28870A0A0A6YW38 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28870A0A0A6YW38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28870A0A0A6YW38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28870A0A0A6YW38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm28870A0A0A6YW38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28870A0A0A6YW38 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm28870A0A0A6YW38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28870A0A0A6YW38 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28870A0A0A6YW38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28870A0A0A6YW38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28870A0A0A6YW38 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28870A0A0A6YW38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28870A0A0A6YW38 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28870A0A0A6YW38 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28870A0A0A6YW38 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28870A0A0A6YW38 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28870A0A0A6YW38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28870A0A0A6YW38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28870A0A0A6YW38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28870A0A0A6YW38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28870A0A0A6YW38 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28870A0A0A6YW38 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28870A0A0A6YW38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28870A0A0A6YW38 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm28870A0A0A6YW38 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28870A0A0A6YW38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28870A0A0A6YW38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28870A0A0A6YW38 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28870A0A0A6YW38 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28870A0A0A6YW38 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28870A0A0A6YW38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28870A0A0A6YW38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28870A0A0A6YW38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms