Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm6S4R1W5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm6S4R1W5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm6S4R1W5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm6S4R1W5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm6S4R1W5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm6S4R1W5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm6S4R1W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms